Les mutations des gènes CHST14 et DSE perturbent la biosynthèse des glycosaminoglycanes. La mutation du gène CHST14 entraîne une carence en dermatane sulfate (glycosaminoglycane) dans les fibroblastes (cellules qui synthétisent la matrice extracellulaire du tissu conjonctif ; qui se retrouve largement dans la peau, les tendons, le cartilage et la paroi aortique) et altère la liaison fibrillaire du collagène dans les faisceaux de collagène. La mutation du gène DSE entraîne une perturbation de la production de dermatane sulfate, ce qui aboutit également une carence de ce glycosaminoglycane. La carence en dermatane sulfate impacte la stabilité et l’élasticité du tissu conjonctif.
Le SED-mc est une maladie génétique autosomique récessive, ce qui signifie que les deux parents doivent chacun être porteurs d’une mutation sur le gène CHST14 ou DSE pour que leur enfant développe la maladie.